库珀中枪后躺在地上，他幻想中出现了一个老糊涂的服务员和一个神秘的巨人，巨人给了他几个线索，特别是三个人见过劳拉的凶手，但没有人见过他的尸体。火灾后，谢莉和凯瑟琳的丈夫皮特·马特尔从昏迷中恢复过来，而凯瑟琳失踪，乔茜为了避嫌逃跑。利奥在警方的看护下从枪伤中恢复。阿尔伯特回到双峰镇调查库珀的枪击案，但库珀很快回到工作岗位，并意识到利奥不可能是凶手，因为他在同一凶手杀死前一个受害者时正在监狱里坐牢。雅各比在医院回忆起在雅克被杀的同时闻到了烧焦的机油味。一夜之间，利兰的头发完全变白，而麦迪在看到地毯上满是血迹的噩梦变成现实时感到恐惧。意识到利奥和雅克都不可能是凶手，库珀和警方推测必然有第三人参与其中。奥黛丽在“单眼杰克”发现自己完全无法应对。罗内特在昏迷中惊恐地看到鲍勃杀害劳拉的幻象。

阿尔伯特透露库珀以前的疯狂搭档温多姆·厄尔已从精神病院逃脱。唐娜接替劳拉成为“送餐上门”志愿者，以调查潜在嫌疑人，于是与卧床不起的特蕾蒙德夫人及其孙子发生了诡异的遭遇。特蕾蒙德抱怨她盘子上的奶油玉米，不料当唐娜转身时，奶油玉米神奇地出现在特蕾蒙德的孙子手中。罗内特从昏迷中醒来，惊恐地认出鲍勃就是袭击她的人。安迪发现自己不育，得出结论露西一定有外遇。利兰认出通缉海报上的鲍勃是他小时候住在他祖父家附近的一个人。利奥处于植物人状态，鲍比策划让谢莉继续照顾利奥，以便她可以领取残疾人津贴，而且能够和鲍比住在一起。鲍比的父亲，加兰德·布里格斯少校，为美国空军监测深空探测工作，向库珀传达了探测器的一条神秘信息：“猫头鹰并非看起来那样”。麦迪在恐怖的幻觉中看到鲍勃。布莱基得知奥黛丽欺骗她，便将她束缚起来。

库珀在罗内特的指甲下发现了一张写有字母“B”的纸片，与劳拉指甲下的“R”和同一凶手的前一个受害者特蕾莎·班克斯的“T”相匹配。唐娜见到了哈罗德·史密斯，他是劳拉的“送餐上门”服务对象，也是一位广场恐惧症患者。利兰透露鲍勃的真名是罗伯逊，小时候住在他避暑别墅附近，曾向他扔火柴并问“你想玩火吗，少年仔？”库珀意识到这些字母是想拼写“罗伯逊”（Robertson）。布莱基将奥黛丽药倒昏迷。雅克的哥哥让·雷诺计划利用奥黛丽引诱库珀到“单眼杰克”杀死他，以报雅克的仇。谢莉拒绝作证利奥参与了锯木厂火灾的事，于是库珀怀疑起她的残疾计划。杰拉德在给杜鲁门卖鞋时看到鲍勃的海报，感到头重脚轻。意识到詹姆斯和麦迪相互吸引，唐娜在劳拉的坟墓前哀叹，因了她的死，事情变得更加复杂。在恍惚状态中，雅各比认出利兰是雅克的凶手，导致杜鲁门逮捕了利兰。唐娜在哈罗德家发现了劳拉的秘密日记。

利兰承认谋杀了雅克。关于化名“M·T·温茨”的美食评论家将到访双峰镇的传言蔓延，汉克兴奋不已，他在双R餐厅与诺玛一起工作，认为正面的评论可能会为餐厅带来新生意。让·雷诺用奥黛丽被囚禁的录影带去勒索本，要求以库珀作为交接人支付12.5万美元的赎金。哈罗德向唐娜朗读了劳拉日记的摘录，但拒绝给她，声称日记中没有关于她谋杀案的证据。乔茜回来了，声称她在西雅图购物，皮特告诉她凯瑟琳被宣告死亡了。露西向安迪透露，她曾与时尚男装销售员迪克·特雷梅恩有过一段恋情，他可能是她孩子的父亲，并且已经向她提供了堕胎的钱。尽管嫉妒于詹姆斯对她的吸引，唐娜还是叫麦迪来帮助，打算取回劳拉的日记。乔茜向皮特介绍了她声称是自己表兄弟的乔纳森。皮特离开后，乔纳森告诉乔茜是时候她回到香港了。后来，乔纳森在双R餐厅粗暴地对待并威胁汉克。

库珀找到奥黛丽的便条，意识到她去了“单眼杰克”。霍克发现利兰声称鲍勃住的房子实际上是两位退休教师所有，他们对鲍勃一无所知。利兰的法庭听证开始时，克林顿·斯特恩伍德法官以保释释放了他，并认为利奥无法受审。斯特恩伍德建议库珀留意森林。艾德那情绪不稳定的妻子纳丁·赫尔利自杀未遂后，精神上倒退到了青少年时期，自认为是一名高中生，并展示了她似乎没有意识到的反常力量。一位日本商人托贾姆拉先生向本提供了五百万美元购买幽林开发项目（位在原锯木厂的地点）。本让库珀交付奥黛丽的赎金。安迪发现他的精子数量奇迹般地恢复了，这意味着他可能是露西孩子的父亲，但他惊恐地意识到她去了堕胎诊所。意识到让·雷诺打算杀死自己，库珀和杜鲁门计划突袭“单眼杰克”。他们救出了奥黛丽，布莱基被杀，但让·雷诺设法逃脱。麦迪和唐娜试图偷走劳拉的日记，但被哈罗德抓住。

詹姆斯救出了麦迪和唐娜，但未能取得劳拉的日记。库珀和杜鲁门发现奥黛丽注射了致命剂量的海洛因，确认让·雷诺是一名加拿大重要的毒品贩子。库珀将赎金归还给本，但奥黛丽拒绝了本的关心。谢莉和鲍比发现利奥的残疾金比他们预期的要少得多。库珀的上司，FBI区域局长戈登·科尔，听力不佳，他透露库珀房间外发现的物质来自于一件小羊驼大衣，杰拉德所使用的药物是一种独特且未知的物质，而在犯罪现场附近发现的纸张来自一本日记。戈登警告库珀不要陷得太深，提到了之前在匹兹堡的一次事件，并传达了一条匿名信息：一步国际象棋开局走法，库珀认为这条信息来自厄尔。库珀和杜鲁门审问杰拉德，后者突然癫痫发作，被迈克附身，他声称是鲍勃以前的搭档，并背诵了一首诗：“透过未来过去的黑暗，魔法师渴望看见，有人在两个世界之间吟唱，与火同行。”（Through the darkness of future past, the magician longs to see, one chants out between two worlds, fire walk with me.）迈克透露鲍勃藏身在大北方酒店。

霍克在唐娜透露哈罗德拥有劳拉的日记后调查哈罗德，但发现他已经上吊自杀，留下一张写着“J'ai une âme solitaire”（法语“我的灵魂是孤独的”）的遗书。麦迪告诉利兰和莎拉她要回家。鲍比在利奥的靴子后跟里发现了一个隐藏的录音带。奥黛丽质问本，说她知道他拥有“单眼杰克”，本承认他与劳拉发生了性关系并爱过她。劳拉日记的书页被复原，揭示劳拉被鲍勃虐待和性侵，并计划“告诉世界关于本·霍恩的事”。奥黛丽透露了她关于本的信息后，库珀和杜鲁门逮捕了他。原木女士告诉库珀在当地酒吧“路屋”有猫头鹰。去路屋酒吧后，在幻象中巨人告诉库珀“事情再次发生”。在帕尔默家，利兰对着镜子微笑，他的倒影是鲍勃。被鲍勃附身的他给莎拉下了药，并谋杀了麦迪，在她的指甲下留了一个字母。在路屋，唐娜、鲍比、詹姆斯和库珀都感觉到发生了什么，显得非常痛苦。那个老糊涂的服务员安慰库珀，告诉他“我很抱歉……”

詹姆斯和唐娜去帕尔默家告别麦迪，但利兰兴奋地告诉他们她已经离开。当他对着镜子调整领带时，鲍勃的脸在镜子里盯着他。杰瑞是个已被吊销资格的律师，现在为本的辩护做准备。本坚称他在劳拉被谋杀的那晚和凯瑟琳在一起，杰瑞意识到这真是个糟糕的不在场证明，因为凯瑟琳已经宣告死亡了。利兰把麦迪的尸体塞进他的高尔夫球袋，开车在镇上兜风，心情异常愉快。当杜鲁门告诉他本被逮捕时，利兰假装震惊，但暗中狡猾地微笑。后来，他被杜鲁门和库珀因鲁莽驾驶而拦下，当他们马上就要发现麦迪时，利兰准备用高尔夫球杆打死他们，但在最后一刻他们被叫走了。鲍比发现利奥隐藏的录音带是本参与锯木厂火灾的证据。凯瑟琳透露她在火灾后幸存下来，并以托贾姆拉的身份伪装，她给本送去了一盘录音带，用此敲诈他，以换取幽林的股份。利兰将麦迪的尸体藏在树林里，后来被杜鲁门和库珀发现。

库珀要求杜鲁门不要立即报告麦迪的死亡，因为他认为自己即将破案。唐娜透露特蕾蒙德的孙子曾对她说“J'ai une âme solitaire”，她决定和库珀以及安迪一起去拜访特蕾蒙德夫人。他们发现一个自称是特蕾蒙德夫人的女人，不过年龄相差几十岁且没有孩子。“特蕾蒙德夫人”给唐娜一个信封，里面有劳拉日记的一页，揭示了劳拉和库珀做过同样的红色房间梦。利兰看到唐娜戴着劳拉的太阳镜，感到不安，后来接到麦迪的母亲的电话，说她失踪了。利兰准备攻击唐娜，但被杜鲁门打断，说又发生了一起谋杀案。唐娜意识到麦迪死了，告诉詹姆斯。詹姆斯骑着摩托车离开镇子。库珀凭直觉带着本、利兰、艾德和布里格斯少校去路屋酒吧。巨人和服务员出现，库珀回忆起劳拉在梦中对他说的话：“是我父亲杀了我”。库珀和杜鲁门逮捕了利兰，鲍勃嘲弄他们。鲍勃离开了利兰的身体，留下利兰对自己的行为感到震惊。库珀在利兰死亡时抱着他。杜鲁门推测鲍勃已经逃脱。

戈登警告库珀，美国缉毒局派出库珀的朋友丹尼斯·布莱森来调查失踪的可卡因。库珀坚称自己是无辜的，坚持必须“专注于棋盘之外”。詹姆斯在公路上骑摩托车，遇到了一位名叫伊芙琳·马什的女人，她在酒吧雇他修理她丈夫的车。为了给露西留下深刻印象，迪克和安迪照顾了一个名叫尼基·尼德尔曼的孤儿。霍克透露，白色小屋是一个只存在于神话中的地方，那里居住着灵体，而要前往那里的人必须首先穿过它的对立面——黑色小屋，勇气不完美者的灵魂将在黑色小屋被他们黑暗的自我消灭。丹尼斯到达双峰镇开始调查。乔茜透露，她曾为一名名叫托马斯·埃克哈特的香港男子工作，她认为他应对她丈夫的死负责，而且埃克哈特想要她回去。库珀收到厄尔的一封信，里面有一步国际象棋走法和一盘录音带，说“王必须死”。乔茜的丈夫安德鲁·帕卡德其实还活着，与凯瑟琳密谋利用乔茜作为诱饵骗艾克哈特现身。

本雇佣鲍比跟踪汉克，后者正在与让和厄尼合作。库珀询问在双峰镇购买房产的事宜；在一间名为“死狗农场”的平房参观时，他发现了轮胎印和可卡因。道吉因心肌梗死发作死亡。德韦恩指责兰娜以性为武器杀死了道吉，兰娜对周围的男人有着致命的吸引力。纳丁加入了高中摔跤队，轻松击败了迈克，她对他有好感。伊芙琳的兄弟马尔科姆向詹姆斯透露，伊芙琳的丈夫经常殴打她，她便报复性地损坏了他的车。迪克和安迪在更换轮胎时差点受伤，车子从千斤顶上掉下来。布里格斯少校的上司，莱利上校，告诉库珀，少校的失踪是国家安全问题，并且他与库珀分享的信息起源于双峰镇附近的森林。凯瑟琳威胁要将乔茜交给埃克哈特，逼迫乔茜当她的女仆。库珀在报纸上发表了对厄尔国际象棋走法的回应，但厄尔预料到了他的回应。丹尼斯勒索厄尼帮她和库珀为让·雷诺设下缉捕圈套。布里格斯少校奇迹般地回到了客厅。

布里格斯少校身上有三个三角形的疤痕。回忆起一只巨大的猫头鹰的幻觉，他变得不安，想知道他的经历是否是要夺取他的灵魂。他想要向库珀解释，美国空军一直在非官方地寻找白色小屋，但被护送少校离开的士兵打断。厄尼焦虑地给让打电话，安排在“死狗农场”进行诱捕行动。迪克开始怀疑尼基可能是撒但的化身，叫来安迪帮忙偷取孤儿院的档案以调查。本自以为是罗伯特·E·李，重演了盖茨堡之役，改变历史，使南方联盟获胜。詹姆斯修好了伊芙琳丈夫的车，与她发生了性关系。杜鲁门授权库珀，两人离开警局展开诱捕行动。让·雷诺破坏了诱捕行动，挟持了库珀。丹尼斯分散了让的注意力，让库珀趁机射杀了让。双峰镇突然停电。利奥从昏迷中醒来，吓坏了谢莉。库珀、杜鲁门和霍克发现停电是由电站火灾引起的。厄尔在杜鲁门的办公室摆放了一具尸体，一只手指向国际象棋棋盘。

库珀准确预测了尸体的伤口。利奥用斧头把谢莉逼在墙角。鲍比及时赶到，分散了利奥的注意力，让谢莉趁机刺伤了他的腿。受伤的利奥在夜色中徘徊。露西和海沃德医生对迪克和安迪试图证明尼基恶意的行为表示鄙视，透露尼基是一生悲剧的受害者。库珀透露，多年前他和厄尔被指派保护厄尔的妻子卡洛琳·鲍威尔，她在目睹了一起联邦犯罪后成为证人。库珀承认自己爱过卡洛琳，她在他被不明袭击者伤害后死亡。库珀相信是厄尔犯下了卡洛琳目睹的犯罪，并谋杀了她。布里格斯少校在谵妄状态下承认，他认为自己在失踪期间被带到了白色小屋。托马斯·埃克哈特抵达双峰镇。乔纳森在西雅图遇害，库珀和杜鲁门怀疑乔茜。伊芙琳透露她的丈夫死于车祸，使詹姆斯意识到她和马尔科姆（其实是她的情人）陷害自己杀死了她的丈夫。利奥跌跌撞撞地穿过树林进入一间小木屋，里面有个男人自我介绍自己叫温多姆·厄尔。

伊芙琳陷害詹姆斯谋杀了她的丈夫。詹姆斯躲开警察与唐娜见面，她想要帮助他证明自己的清白。阿尔伯特回来，警告厄尔已将卡洛琳的衣物碎片寄送到全国各地。厄尔囚禁了利奥，给他戴上了电击项圈，并迫使他抄写一首诗。乔茜拒绝讨论乔纳森的谋杀案。库珀秘密地从她的大衣上取了一根纤维样本，阿尔伯特确认这就是库珀房间外被枪击后发现的小羊驼，极大地指向乔茜是暗杀者。库珀和杜鲁门怀疑，每当厄尔在国际象棋游戏中吃掉一个棋子时，他就会杀死一个人。他们找来国际象棋高手皮特，帮助将游戏逼入欠行僵局，以防止进一步的生命损失。奥黛丽、杰瑞、鲍比和雅各比配合本的幻想，重写历史，使尤利西斯·格兰特投降而不是李，最终让本回归现实。厄尔伪装成其他人，将撕成三份的诗的残片送给了谢莉、奥黛丽和唐娜。马尔科姆想要杀死詹姆斯，但伊芙琳承认她真的爱詹姆斯，之后开枪射杀了马尔科姆。厄尔在库珀的床上放置了卡洛琳的死亡面具和一盘录音带。

厄尔留下信息嘲笑库珀，要他在致命的国际象棋游戏中走棋。阿尔伯特展示了弹道证据，证实乔茜射击了库珀并谋杀了乔纳森，杜鲁门无意中听到了这一切。本雇佣他的商业伙伴约翰·贾斯蒂斯·惠勒来挫败凯瑟琳的幽林开发计划，还与奥黛丽和杰瑞一起制定了一个计划，以抗议不动产开发对松鼬天然栖息地的破坏。凯瑟琳强迫乔茜与埃克哈特见面，乔茜意识到这表示她将不得不返回香港。安德鲁向埃克哈特透露了自己的身份，警告他乔茜是个危险人物。厄尔送给谢莉、奥黛丽和唐娜的除了诗的残片，还有一张在路屋酒吧见面的邀请；她们去了那里，意识到有人安排了这一切。厄尔乔装打扮，在一旁观看，但没有向他们介绍自己。库珀和杜鲁门在大北方伏击乔茜；她开枪打死了埃克哈特，然后死于不明原因。鲍伯的幻象嘲笑库珀，库珀梦中的侏儒也跟着跳舞。乔茜的脸似乎被困在抽屉的木把手里。

杜鲁门为乔茜哀悼，留下库珀和霍克接管警长职责。诺玛的同父异母妹妹安妮·布莱克本到达双峰镇，此前她从修女院逃跑。原木女士被布里格斯少校的疤痕吸引，告诉库珀她小时候曾消失几天，回来时腿上也有类似的疤痕。厄尔意识到库珀试图将游戏逼入僵局。埃克哈特的助手琼斯将一个秘密盒送给凯瑟琳。厄尔伪装成其他人，拜访了唐娜，假装是医学院的同事，给她的父亲留下了礼物。后来，海沃德医生对这次来访感到不安，因为厄尔假扮的同事几年前溺水身亡，而礼物是给库珀的一枚国际象棋棋子。奥黛丽和迪克组织了一场时装表演，以宣传阻止幽林运动，凯瑟琳告诉本，环境影响评价已经证明松鼬不受开发的威胁，并且她知道他是出于自私而不是真正的同情。一只活的松鼬在表演中四处乱跑，破坏了表演。杜鲁门休息时，琼斯闯入，打昏了看守他的警官，与他同床共枕。

琼斯试图勒死杜鲁门，但他设法制服了她。库珀推测埃克哈特希望杜鲁门死去，是因为他对乔茜的婚外情感到性嫉妒。奥黛丽与惠勒调情，后者提出带她乘坐他的私人飞机飞行。一棵盆栽树被送到杜鲁门的办公室，据称是乔茜死前寄来的。库珀和杜鲁门不知道，盆栽是厄尔送来的，他在其中安装了窃听器。戈登回来，恢复了库珀作为联邦探员的身份，并透露厄尔早年曾与布里格斯少校有过接触，两人都对黑白小屋有特别兴趣。厄尔透露他打算杀死即将到来的双峰小姐选美比赛的获胜者。唐娜偷偷跟踪伊琳去见本。戈登见到了谢莉，他出乎意料地不用助听器也能听见她的声音。安妮认出布里格斯少校和原木女士的疤痕是猫头鹰洞穴中的岩刻。唐娜收到詹姆斯的明信片，他已经去了墨西哥清醒头脑，但承诺会回来。库珀发现了岩刻，但无法理解其含义。后来，厄尔也来到了这里，洞穴的墙壁剧烈震动。

库珀和杜鲁门意识到厄尔已经来过猫头鹰洞穴。厄尔绑架了流浪音乐家拉斯蒂·托马斯基，告诉他关于黑色小屋和他渴望利用其邪恶力量的事情。凯瑟琳请求皮特帮助打开秘密盒。兰娜现在与德韦恩有关系，说服他操纵双峰小姐比赛——他是其中一名评委——以便她能赢得比赛。库珀将诗的笔记与厄尔和利奥的逮捕报告相对照，意识到是利奥写了这首诗。厄尔将拉斯蒂困在一个张子制的国际象棋卒子里，然后用弩杀死了他。皮特不小心把秘密盒摔在地上，却打开了它，里面露出了一个更小的金属立方体。库珀和安妮在一起度过了一段时间，他们谈论了彼此困扰的过去——库珀未能保护卡洛琳，安妮在去修道院前曾尝试自杀。戈登与谢莉调情并亲吻了她，让鲍比嫉妒。迪克主持了一场品酒会，以宣传阻止幽林运动，他的自负行为激怒了露西。唐娜向伊琳施压，询问她与本的会面，伊琳坚称只不过与慈善事业有关。杜鲁门在公园发现了拉斯蒂的尸体，藏在卒子里。

库珀意识到厄尔的国际象棋游戏正走向一个暴力的结局。惠勒透露他必须立即前往巴西。唐娜发现她的出生证明书上没有列出父亲的名字。布里格斯少校透露厄尔对“dugpas”（纯邪恶的存在）着迷。库珀推测厄尔来到双峰镇真正的动机是为了寻找黑色小屋。双峰镇的几个人突然遭受突发的手部震颤。谢莉和鲍比重归于好。奥黛丽坚持让皮特开车送她去机场，赶上惠勒离开前见他一面。厄尔用麻醉枪射中了布里格斯少校。奥黛丽和惠勒在飞机上做爱，让皮特感动得流下了眼泪，然后他也遭受了手部震颤。厄尔给布里格斯少校打针，审问关于黑色小屋的事情，得知它将在“木星和土星相遇”时开启。安德鲁用擀面杖砸开第二个秘密盒，里面露出了一个更小的金属立方体。库珀和安妮在路屋跳舞，之后巨人在库珀面前挥舞双臂，用口型说“不”。厄尔意识到岩刻是通往黑色小屋的地图。在树林中，鲍勃从明亮的光芒中出现，红色房间的帷幕在他下方映照。

利奥解救了布里格斯少校，恳求他救救谢莉。奥黛丽发现幽林是由双峰储蓄贷款协会秘密资助的。库珀推测鲍勃被乔茜的恐惧所吸引，恐惧正是通往黑色小屋的关键。厄尔把利奥留下独自离开，利奥头顶上用滑轮悬挂着一笼捕鸟蛛。唐娜要求父母告诉她伊琳和本之间事情的真相，但他们拒绝。库珀认出岩刻上的两个符号是木星和土星，推测黑色小屋将在木星和土星即将对齐时开启。布里格斯少校使用氟哌啶醇后略微恢复理智，他含糊不清地说“恐惧和爱打开大门”，并提到了女王，让库珀意识到厄尔将带走双峰小姐比赛的获胜者进入黑色小屋。当晚比赛中，唐娜在和本当面对质，本承认曾与伊琳有染，可能是唐娜的父亲。安妮赢得了比赛。伪装成原木女士的厄尔关掉灯光，释放烟雾弹。灯光再次打开时，厄尔和安妮不见了。

厄尔带着安妮进入树林中的一个小树丛，他们在红色房间的帷幕后消失。纳丁在混乱中头部受伤，却意外恢复了真实年龄，让迈克感到失望，因为他已经真心爱上了她。本想要与海沃德家和解，但海沃德医生激烈地攻击了他。安德鲁和皮特发现金属立方体里面是个保险箱钥匙。奥黛丽为了抗议幽林将自己锁在银行金库内，同时安德鲁和皮特到达银行解锁保险箱，结果触发了埃克哈特安置的炸弹，炸死了他们俩。库珀独自追踪厄尔和安妮进入红色房间。莎拉以扭曲的声音告诉布里格斯少校：“我和戴尔·库珀在黑色小屋里。我在等你。”库珀在红色房间与矮人和劳拉坐在一起，劳拉告诉他：“25年后再见。”库珀看到了那个老糊涂的服务员、巨人、安妮、卡洛琳、劳拉、鲍勃以及最后是厄尔的幻觉。厄尔要求以安妮的生命交换库珀的灵魂，结果鲍勃反而夺走了厄尔的灵魂。库珀被自己的分身追赶并抓住。几小时后，库珀和安妮在小树林中出现。库珀被带回大北方酒店，他对着镜子猛击自己的头部，镜子中的倒影是鲍勃，他嘲弄地重复着“安妮怎么样？”